会计机构负责人和会计主管人员主要是就职范围的区别，会计机构负责人指的是设置了会计机构单位所任命的全面负责该机构工作的人员；会计主管人员是指的是在不设置会计机构，只在其他设置专职会计人员的机构单位中行使会计机构负责人职权的人员。
会计主管人员与会计机构负责人同样是对单位的全部会计工作负有全面组织和领导的责任，然后按照统一规定的财务制度，结合本单位的实际情况，制定本单位的财务会计制度和具体办法，以及负责组织编制单位的预算、财务收支计划，检查预算执行情况，最后负责审查上报的财务会计报表和资料，并做好年终决算工作。
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