事业单位的会计科目有五类，包括资产类、负债类、净资产类、收入类以及支出类，每个科目都有各自的内容。事业单位会计是不以营利为目的，具有较强的社会性。
其中，资产类包括零余额账户用款额度、财政应返还额度、存货、长期投资、待处置资产损益；负债类科目主要包括短期借款、应交税费、应缴国库款、应缴财政专户款。净资产类科目主要包括专用基金、财政补助结余、非财政补助结转、经营结余、非财政补助结余分配等科目；收入类科目主要包括事业收入、财政补助收入、上级补助收入、附属单位上缴收入、经营收入等科目；支出类科目包括上缴上级支出、事业支出、经营支出等。
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